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616b903aec
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@ -1,322 +0,0 @@
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{
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"cells": [
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{
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"cell_type": "code",
|
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"execution_count": 1,
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"id": "5a38ed25",
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"metadata": {
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"ExecuteTime": {
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||||||
"end_time": "2022-12-31T17:12:28.663839Z",
|
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||||||
"start_time": "2022-12-31T17:12:25.134607Z"
|
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||||||
}
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},
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"outputs": [],
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"source": [
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"import sys\n",
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"import numpy as np\n",
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"import matplotlib.pyplot as plt\n",
|
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||||||
"import joblib\n",
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|
||||||
"import scienceplots\n",
|
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||||||
"sys.path.append(\"../\")\n",
|
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||||||
"import csiborgtools\n",
|
|
||||||
"\n",
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||||||
"plt.style.use([\"science\", \"notebook\"])\n",
|
|
||||||
"%matplotlib widget\n",
|
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||||||
"%load_ext autoreload\n",
|
|
||||||
"%autoreload 2"
|
|
||||||
]
|
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||||||
},
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||||||
{
|
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||||||
"cell_type": "code",
|
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||||||
"execution_count": 2,
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"id": "22130d0b",
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||||||
"metadata": {},
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||||||
"outputs": [],
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||||||
"source": [
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"d = np.load(\"/mnt/extraspace/rstiskalek/csiborg/split/clumps_07444_00951.npz\")"
|
|
||||||
]
|
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||||||
},
|
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||||||
{
|
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||||||
"cell_type": "code",
|
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||||||
"execution_count": 12,
|
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||||||
"id": "4d9d9d11",
|
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||||||
"metadata": {},
|
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||||||
"outputs": [
|
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||||||
{
|
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||||||
"name": "stdout",
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||||||
"output_type": "stream",
|
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||||||
"text": [
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||||||
"772 µs ± 4.01 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1,000 loops each)\n"
|
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||||||
]
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||||||
}
|
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||||||
],
|
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||||||
"source": [
|
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||||||
"%timeit d[\"232\"]"
|
|
||||||
]
|
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||||||
},
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||||||
{
|
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||||||
"cell_type": "code",
|
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||||||
"execution_count": null,
|
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||||||
"id": "66f32cef",
|
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||||||
"metadata": {},
|
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||||||
"outputs": [],
|
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||||||
"source": []
|
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},
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||||||
{
|
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"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 2,
|
|
||||||
"id": "8a24c0fa",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"paths = csiborgtools.read.Paths(**csiborgtools.paths_glamdring)\n",
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||||||
"# cat = csiborgtools.read.ClumpsCatalogue(7444, paths)"
|
|
||||||
]
|
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||||||
},
|
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||||||
{
|
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||||||
"cell_type": "code",
|
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||||||
"execution_count": 3,
|
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||||||
"id": "6e3ba9f4",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [
|
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||||||
{
|
|
||||||
"data": {
|
|
||||||
"text/plain": [
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||||||
"'/mnt/extraspace/rstiskalek/csiborg/knn/auto/knncdf_07444_la.npz'"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"execution_count": 3,
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"output_type": "execute_result"
|
|
||||||
}
|
|
||||||
],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"paths.knn_path(7444, \"auto\", \"la\")"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 8,
|
|
||||||
"id": "2f4793b9",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"np.savez(\"test.npz\", a=np.random.rand(510, 510, 510), b=np.random.rand(510, 510, 510))"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 15,
|
|
||||||
"id": "041d80d8",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"d = np.load(\"test.npz\")"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 16,
|
|
||||||
"id": "dc320130",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"data": {
|
|
||||||
"text/plain": [
|
|
||||||
"['a', 'b']"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"execution_count": 16,
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"output_type": "execute_result"
|
|
||||||
}
|
|
||||||
],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"d.files"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 7,
|
|
||||||
"id": "11231e20",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"data": {
|
|
||||||
"text/plain": [
|
|
||||||
"['a', 'b']"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"execution_count": 7,
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"output_type": "execute_result"
|
|
||||||
}
|
|
||||||
],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"d.files"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "0b6d02f8",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 26,
|
|
||||||
"id": "4ae2a2a8",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"np.save(\"test.npy\", np.array([]))"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 27,
|
|
||||||
"id": "b675510f",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"data": {
|
|
||||||
"text/plain": [
|
|
||||||
"array([], dtype=float64)"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"execution_count": 27,
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"output_type": "execute_result"
|
|
||||||
}
|
|
||||||
],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"np.load(\"test.npy\")"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "6f8f96b7",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "b4b63c20",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 21,
|
|
||||||
"id": "1cdcf448",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"data": {
|
|
||||||
"text/plain": [
|
|
||||||
"'/mnt/extraspace/rstiskalek/csiborg/split/ic_00952/out_07444_123.npz'"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"execution_count": 21,
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"output_type": "execute_result"
|
|
||||||
}
|
|
||||||
],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"# paths.split_path(123, 7444, 952)"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 4,
|
|
||||||
"id": "d07431f5",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"nsim = 7444\n",
|
|
||||||
"nsnap = max(paths.get_snapshots(7444))\n",
|
|
||||||
"reader = csiborgtools.read.ParticleReader(paths)"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 14,
|
|
||||||
"id": "def3c21f",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"\n",
|
|
||||||
"# clumpind = reader.read_clumps(nsnap, nsim, cols=\"index\")[\"index\"]"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "832e82ce",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "aa69261b",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": 17,
|
|
||||||
"id": "105dd2e2",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": [
|
|
||||||
"parts = np.load(\"/mnt/extraspace/rstiskalek/csiborg/initmatch/clump_7468_particles.npy\", allow_pickle=True)"
|
|
||||||
]
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "c49f174b",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
},
|
|
||||||
{
|
|
||||||
"cell_type": "code",
|
|
||||||
"execution_count": null,
|
|
||||||
"id": "38e9490d",
|
|
||||||
"metadata": {},
|
|
||||||
"outputs": [],
|
|
||||||
"source": []
|
|
||||||
}
|
|
||||||
],
|
|
||||||
"metadata": {
|
|
||||||
"kernelspec": {
|
|
||||||
"display_name": "venv_galomatch",
|
|
||||||
"language": "python",
|
|
||||||
"name": "python3"
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"language_info": {
|
|
||||||
"codemirror_mode": {
|
|
||||||
"name": "ipython",
|
|
||||||
"version": 3
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"file_extension": ".py",
|
|
||||||
"mimetype": "text/x-python",
|
|
||||||
"name": "python",
|
|
||||||
"nbconvert_exporter": "python",
|
|
||||||
"pygments_lexer": "ipython3",
|
|
||||||
"version": "3.8.0"
|
|
||||||
}
|
|
||||||
},
|
|
||||||
"nbformat": 4,
|
|
||||||
"nbformat_minor": 5
|
|
||||||
}
|
|
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